研究人員發現，開普獅在滅絕前基因多樣 。來源：遺傳雜志（2023） 。DOI:10.1093/jhered/esad081
據伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校（Shelby Lawson）：開普獅曾經在南非的開普平原草原上游蕩，現在被稱為西普羅維登斯角 。當歐洲人在17世紀中期抵達南非時，開普獅和許多其他非洲食肉動物和草食動物被獵殺，作為保護牲畜和人類的農業活動 。到19世紀中期，也就是歐洲人來到這里不到200年的時候 ， 開普獅已經被獵殺到滅絕 。
歐洲博物學家描述開普獅有著特別黑色的鬃毛 ， 并且在形態上很獨特 。然而，土著人對開普獅的其他描繪和描述報告了混合或淺色鬃毛 。為了闡明這種差異 ， 最近發表在《遺傳雜志》上的一項研究，由伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的一組研究人員領導，將開普獅的遺傳多樣性和獨特性與13個非洲國家的現代獅進行了比較 。
該團隊的成員包括卡爾·R·沃伊斯基因組生物學研究所的研究人員，包括博士后研究員兼第一作者Alida de Flamingh、人類學教授Ripan Malhi（獨聯體聯合領導人/GSP/GNDP/IGOH）、動物科學教授Alfred Roca（EIRH/GNDP）和綜合生物學副教授Julian Catchen（獨聯體/GNDDP） ， 以及羅斯福大學和菲爾德博物館的生物學家 。
羅斯福大學名譽教授Julian Kerbis Peterhans說：“有趣的是，開普獅的學名Panthera leo blackohaitus的字面意思是黑色鬃毛，但這種描述是基于一個標本 。” 。“從歷史上看 ， 我們看到了很多像獅子這樣巨大而有吸引力的生物的例子，每個人都想聲稱他們發現了一個新的物種，而不考慮種群的變化，也不考慮這個物種是否獨特 。”
早期的研究集中在開普獅基因組的有限片段上，首次表明這些獅子可能不像最初認為的那樣獨特 。然而，這項研究首次對整個開普獅基因組與非洲當代獅子種群進行了全面檢查 。
研究小組從目前存放在菲爾德博物館的兩個開普獅頭骨中采集了樣本 。這些頭骨最初在開普敦的南非研究所展出（1828-1838），作為動物標本制作支架的組成部分 。有充分記錄的頭骨歷史使研究人員能夠在特定的時間范圍內了解開普獅子的多樣性 。
菲爾德博物館生物學家Thomas Gnoske說：“與世界上大多數其他開普獅標本不同，這些標本有著可追溯的歷史和地理收藏位置，所以它們有譜系 。” 。“因此，這是一個很好的機會和挑戰，看看最新的基因組方法的應用可以告訴我們這些標本的情況 。”
從頭骨中收集的基因組數據與非洲其他53只獅子的118個現有有絲分裂基因組和核基因組進行了比較 。通過補充基因組分析，他們發現開普獅的基因組是多樣的 ， 并證明了其與非洲南部和東部其他獅子的基因組聯系 。雖然研究人員承認只有兩個開普獅樣本的局限性，但他們強調，研究結果表明，在非洲這些地區的歷史和一些當代獅子種群中，開普獅的遺傳特征仍然存在 。
de Flamingh說：“最令人驚訝的事情之一是，我們在開普獅種群中發現了如此高的遺傳多樣性 。” 。“兩個頭骨都來自同一個小區域，但它們有著截然不同的線粒體DNA譜系和核基因組 。這告訴我們，在它們被滅絕之前，開普島上生活著基因多樣的獅子 。”
研究人員還發現，開普獅的基因組表現出高度的雜合性，并且缺乏通常與小種群和近親繁殖有關的特征——這些特征在面臨種群減少的瀕危物種中經常觀察到 。考慮到頭骨的采集距離該物種的滅絕有多近，開普獅基因組中這種意外缺失的特征尤其值得注意 。
de Flamingh解釋道：“犀牛或黑足雪貂等當代極度瀕危且面臨滅絕高風險的物種，其有效種群規模往往非常小，這導致近親繁殖和缺乏雜合性 。” 。“開普獅沒有任何這些基因組特征 。這意味著開普獅被獵殺得如此之快，以至于它們的基因組沒有時間積累長期小種群規模的特征 。”
在開普獅基因組中觀察到的豐富性表明，這些獅子可能表現出顯著的表型變異，包括不同的鬃毛顏色 。這與該物種的替代描述和土著觀點更為一致 ， 研究人員表示，這些描述和觀點強調了整合不同知識系統對增強我們對物種歷史的理解的重要性 。
Malhi說：“對我來說 ， 這項研究的主要收獲與開普獅子無關 。” 。“我們從基因組數據和分析中獲得的信息與基于殖民地描述的開普獅的想法不符 。這項研究是一個很好的例子，表明使用非該地區人的信息來識別模式標本可能會導致忽視種群的多樣性 ， 而這對理解進化至關重要 。”
該團隊認為，這一發現為制定未來的保護策略提供了見解，尤其是對非洲當代獅子物種 。研究結果強調了跨國家公園和加強非洲各地人口之間的基因連接的重要性，以保持基因多樣性和流動性 。
de Flamingh說：“與菲爾德博物館等博物館合作是一個令人興奮的機會，可以應用古代DNA分析來更好地了解人類與動物的互動 。” 。“我認為，隨著我們基因技術的不斷進步，這一領域將得到越來越多的研究 。”

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