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選擇基因組測序物種的方法

【選擇基因組測序物種的方法】迄今已被測序的細(xì)菌和古細(xì)菌基因組之所以被選擇測序,主要是考慮到它們的生理問題 。這種選擇依據(jù)并沒錯(cuò),但卻導(dǎo)致了明顯的系統(tǒng)發(fā)育偏頗 。在“細(xì)菌和古細(xì)菌基因組百科全書”(GEBA)項(xiàng)目中,研究人員采用了另一種方法,該方法主張根據(jù)生物的系統(tǒng)發(fā)育位置來選擇基因組,其目的是填補(bǔ)在生命樹的細(xì)菌和古細(xì)菌分支測序中的空白 。這一方法的價(jià)值已被一項(xiàng)示范研究的成果證實(shí),即選擇用來擴(kuò)大系統(tǒng)發(fā)育覆蓋面的56個(gè)可培育物種基因組序列的發(fā)布 。對這些序列進(jìn)行分析,可提供系統(tǒng)發(fā)育、蛋白功能和基因組注解等方面的信息 。

作者:田天
來源:科學(xué)時(shí)報(bào)