財政專項基金和專項資金的區別如下:
1、用途不同
地方專項資金來源主要是地方財政部門安排的預算內資金、預算外資金、上級補助或上級撥款的資金、政府性基金及轉移支付資金等;
而財政專項基金的使用主要是地方政府承擔的基礎設施建設和發展及其他專項事業支出等 。

2、制度不同
專項資金的撥付本著專款專用的原則,嚴格執行項目資金批準的使用計劃和項目批復內容,不準擅自調項、擴項、縮項,更不準拆借、挪用、擠占和隨意扣壓;資金撥付動向,按不同專項資金的要求執行,不準任意改變;特殊情況,必須請示 。
而嚴格財政專項基金初審、審核、審核制度,不準缺項和越程序辦理手續,各類專項資金審批程序,以該專項資金審批表所列內容和文件要求為準 。
3、特點不同
財政專項基金以資本金投入方式對科技型中小企業進行補助, 主要目的在于引導其他資本的投入, 數額一般不超過企業注冊資本的20% ,原則上可以依法轉讓, 或者采取合作經營的方式在規定期限內依法收回投資 。
而專項資金不同于財政直接補貼,它有嚴格的管理要求,需要在基金設立之前就必須明確資金的數量、用途、對象、支付方式和補貼方式 。
參考資料來源:百度百科-財政專項基金
百度百科-專項資金
【財政專項基金和專項資金有什么區別】
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