基因工程技術的發展方向主要有以下方面：
基因工程與醫藥衛生
1．生產基因工程藥品：用基因工程方法生產的“工程菌”可以高效率地生產出高質量，低成本的藥品 。
2．用于基因診斷和基因治療：
（1）基因診斷：用放射性同位素（如32P），熒光分子等標記的DNA分子做探針，利用DNA分子雜交原理，鑒定被檢測標本的遺傳信息，達到檢測疾病的目的 。
（2）基因治療：把健康的外源基因導入有基因缺陷的細胞中，達到治療疾病的目的 。
【基因工程技術的發展方向】基因工程與農牧業，食
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